口袋妖怪火红的主线剧情通关时间因玩家操作熟练度和队伍培养策略而异，但通常需要20至30小时完成基础流程。游戏的核心目标包括挑战8个道馆、击败四大天王及冠军，同时穿插火箭队相关剧情。主线推进速度受队伍等级、道具收集效率以及迷宫探索深度影响，若专注于关键任务且合理规划路线，通关时长可控制在较短时间内。
游戏厅剧情主要涉及彩虹市火箭队基地的潜入任务，该环节平均耗时约1至2小时。玩家需在游戏厅内击败火箭队成员，通过海报后的隐藏通道进入地下基地，破解垃圾桶机关并击败坂木老大获取观测镜。这部分剧情与紫苑镇宝可梦塔的幽灵事件直接关联，属于中期关键任务链。流程中需注意地下四层的电梯钥匙获取及B2层迷宫路线选择，避免因重复探索延长耗时。
主线剧情的时间分配呈现明显阶段性特征。前期道馆挑战（尼比市至枯叶市）约需5至8小时，中期剧情转折点（圣安奴号船票至彩虹市）约7至10小时，后期联盟挑战及收尾任务约8至12小时。游戏厅任务作为承上启下的节点，其完成效率直接影响后续紫苑镇剧情的解锁速度。部分玩家可能因未及时获取关键道具如居合斩或闪光术，导致流程出现卡顿。
通关后的内容扩展主要依赖二周目七岛剧情，但主线终局即首次击败冠军的节点可作为基准。游戏内置的辅助机制如战斗探测器可提升训练师重复对战效率，而合理利用属性克制能显著减少BOSS战耗时。对于速通玩家而言，精准的资源管理和路线优化可将通关时间压缩至更低，但常规体验仍需保持适度探索节奏。
