口袋妖怪漆黑的魅影5.0EXDP是基于经典GBA游戏口袋妖怪的改版作品，在保留原版核心玩法的基础上，增加了新的剧情、精灵和挑战内容。该版本支持穿墙、快速升级等可选作弊功能，并修复了大量BUG，同时引入了部分第五代精灵的特性、技能和道具。与BW版的主要区别在于初始三只精灵不同，但主宠捕捉地完全一致。游戏流程分为三个周目，一周目包含火箭队剧情，二周目新增八个道馆、新的联盟及银河团与等离子团剧情，三周目则开放类似黑白2PWT的对战设施魅影摩天楼，可挑战历代馆主、天王和冠军。
一周目攻略从选择性别和名字开始，首发场景是小田卷博士的研究所，主角因不明原因陷入沉睡，需通过阿克罗玛的装置引导清醒。初始精灵可从神奥版或伊修版的主宠中选择，随后在幻影之森遇到伪装的劲敌，击败佐罗亚后其会加入队伍。橙华市道馆需先帮助小光学习捕捉精灵的方法，之后才能挑战。卡那兹市的岩石系道馆馆主为杜鹃，战胜后可获得居合斩秘传机器。游戏过程中会遭遇水舰队成员，需在橙华森林击败他们以获取超级球。
二周目剧情从家中开始，米可利来电要求寻找其他冠军的秘密基地，随后需前往水静市魅影摩天楼门口与其会合。此阶段开放梦世界探索，在橙华森林中间可捕捉Lv.30雪拉比，通过梦之实验室进入世界狭缝后可挑战小智的满级队伍。火箭队剧情中需对抗Lv.100的梅卡阳玛、双弹瓦斯等精灵。梦源镇最下方的房屋内入睡可触发克雷赛利亚捕捉事件，红莲之窟深处则开放维库提尼的捕获点位。
三周目核心内容为魅影摩天楼的挑战，需击败六个地区的馆主、天王及冠军，所有对手精灵均为满级。每完成一个区域可获得大师球、神奇糖果等奖励。最终与艾沃利对战后获得天界之笛，借此进入Abando世界的亚空间，挑战火箭队三人组及坂木的人格代码模拟战。游戏还隐藏着恶势力头目五连战等高难度内容，需合理搭配精灵属性与技能。
该版本在精灵培养方面提供了多样化选择，如通过即时存档功能配合红线和不变石孵化高个体值精灵。部分神兽需特定条件触发，如雷公位于紫堇市新紫堇发电厂深处，超梦则需在茵郁市右侧湖中的天旱焦岩捕获。道具收集方面，绿荫镇右下角可获取感恩之花，废弃船仓库钥匙能解锁TM35喷射火焰等实用技能机器。
漆黑的魅影5.0EXDP通过三周目架构和丰富的支线设计，为玩家提供了远超原版的游戏体量。攻略过程中需注意精灵属性克制、技能搭配及关键道具获取，合理利用作弊功能可降低重复操作带来的枯燥感，但核心挑战仍需依靠策略与培养完成。
